El Centro SIG tendrá autonomía administrativa y financiera de acuerdo con la Política de Creación y Funcionamiento de los Centros de Investigación y Postgrado de la UNAN-León. Las inversiones para el desarrollo de sus procesos estratégicos provendrán de fondos obtenidos por concurso, por patrocinio o por donación directa.

Otra fuente importante de financiamiento de las actividades del Centro será la generada por actividades que reporten ingresos propios al Centro. La UNAN-León realizará un aporte inicial al Centro SIG en términos de la infraestructura, servicios básicos y Recursos Humanos que sean requeridos para un funcionamiento adecuado.